基础医学实验中心是集科研及教学于一体的院部教学机构。基础实验中心设备齐全、技术先进，下设五个教学实验室（解剖实验室、机能实验室、病原生物学实验室、生物化学实验室、病理与组胚实验室）和1个科研实验室（中心实验室），其中教学实验室面向的学科有《人体解剖学》、《机能实验学》、《病原生物学与免疫学》、《生物化学》、《组织胚胎学》、《病理学》等，科研实验室是供全校师生共享的开放性科研平台。

基础医学实验中心的总面积约4606平方米。实验实训房间共30个，中心实验室的房间共7个。基础医学实验中心的仪器设备的总值约1473万元，其中五万元以上的大型仪器设备27台，主要有凝胶成像系统、发酵罐、酶标仪、半自动生化分析仪、高压液相色谱仪、生物安全柜、生物显微镜、超纯水系统、紫外分光光度计、实时定量PCR仪、电穿孔仪、荧光倒置显微镜、化学发光凝胶成像系统、超微量微孔板分光光度计等，利用这些仪器设备可以进行实时定量PCR、细菌培养、细胞培养、蛋白层析等科研项目，仪器设备能够满足基础医学实验教学的需要。

基础医学实验中心具有一支素质一流、业务精良、结构合理的人才队伍。实验中心的专职管理人员1人，实验技术人员10人。其中拥有高级职称人员6人，硕士5人。基础医学实验中心全体同仁奉守工匠精神、遵循创新理念为校内外教学和科研服务。